季節は過ぎもうすぐ二度目の春――
　　劣等生の兄と優等生の妹ふたりの魔法科高校での生活はその一学年目を終えようとしていた
　　達也そして深雪たちは春休みを利用して小笠原諸島のとある別荘へと休暇に訪れていた
　　束の間の休息に羽根を伸ばす達也たち
　　しかしそんな達也たちの前にひとりの少女九亜が現れる海軍基地から脱走してきたその少女は達也にひとつの願いを告げる――