女娲大神为了造福苍生而创造的神兵兽在新一辑故事中再次面临挑战黑暗势力元始天魔千方百计将神兵小将和神兽引领到神秘岛国「山外山」；天魔希望利用神兵小将的纯洁和正义获得「山外山」五大守护圣兽的信任将其圣洁的力量交予问天和天晶兽；然后再指使大坏蛋无敌盟主看准时机从他们身上夺取圣兽的力量以解除封印美丽的宇宙随即陷入被毁灭的恐慌之中
在「山外山」旅程后「神兽之乡」的旅程又拉开帷幕问天等人来到神兽学校修炼居然卷入了一场布偶战争之中布偶王子想让所有神兽变成木偶可是经过详细的调查发现外表邪恶来自于布偶乐园的布偶王子竟是宽容与纯真的兄弟幕后主使的坏蛋三兄弟和盖世太保把宽容等人的三兄弟分散的邪恶神兽在布偶王子背叛他们后趁机绑架布偶王子他们一行人又怎么克服此次困难呢
